Como una importante herramienta para la toma de decisiones el proyecto ha fortalecido la infraestructura y capacidades técnicas y profesionales necesarias para mantener un programa de monitoreo y de evaluaciones de la biodiversidad y el medio ambiente con fines de manejo y conservación. Para ello se construyeron 5 laboratorios, que abarcan territorialmente todo el ESC (uno en cada una de las cinco provincias). Se cuenta con una red de estaciones de monitoreo elaborada participativamente según un análisis de problemas, se identificaron los indicadores de monitoreo, las metodologías y la frecuencia de monitoreo, y se elaboraron 29 Protocolos de monitoreo, 12 marinos y 17 terrestres.
También se ha establecido una Red de Monitoreo de voluntarios de Alerta Temprana en Arrecifes Coralinos.
- Red de Monitoreo Voluntario de Alerta Temprana de Arrecifes Coralinos
- Red de Laboratorios de monitoreo de la biodiversidad
- Evaluación del estado de salud de los arrecifes coralinos del Archipiélago Sabana-Camagüey
- Estructura de la comunidad de Octocorales de una zona propuesta como área protegida en Cayo Coco, Cuba.
